Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stxbp3Q60770 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stxbp3Q60770 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms