Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf3Q60765 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms