Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mkrn3Q60764 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms