Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd4Q60688 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms