Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms