Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Satb1Q60611 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms