Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CttnQ60598 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CttnQ60598 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CttnQ60598 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CttnQ60598 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CttnQ60598 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CttnQ60598 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CttnQ60598 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CttnQ60598 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CttnQ60598 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms