Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc11Q5U458 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms