Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYD0

Myo1d, Unconventional myosin-Id, mousemouse

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1dQ5SYD0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Myo1dQ5SYD0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms