Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Vmn1r196Q5SVD5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Vmn1r196Q5SVD5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Vmn1r196Q5SVD5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Vmn1r196Q5SVD5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Vmn1r196Q5SVD5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Vmn1r196Q5SVD5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Vmn1r196Q5SVD5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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