Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV77

Ggnbp2, Gametogenetin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp2Q5SV77 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ggnbp2Q5SV77 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ggnbp2Q5SV77 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ggnbp2Q5SV77 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ggnbp2Q5SV77 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ggnbp2Q5SV77 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ggnbp2Q5SV77 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ggnbp2Q5SV77 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggnbp2Q5SV77 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms