Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd40Q5SUE8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms