Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam71bQ5STT6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms