Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tns3Q5SSZ5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tns3Q5SSZ5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms