Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psme4Q5SSW2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms