Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms