Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms