Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI5

Brsk1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk1Q5RJI5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Brsk1Q5RJI5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms