Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav8d-2Q5R1B6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms