Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms