Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttf2Q5NC05 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms