Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpm3Q5F4S9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpm3Q5F4S9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpm3Q5F4S9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpm3Q5F4S9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpm3Q5F4S9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpm3Q5F4S9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpm3Q5F4S9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpm3Q5F4S9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpm3Q5F4S9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpm3Q5F4S9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpm3Q5F4S9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpm3Q5F4S9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpm3Q5F4S9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpm3Q5F4S9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpm3Q5F4S9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpm3Q5F4S9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpm3Q5F4S9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpm3Q5F4S9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpm3Q5F4S9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpm3Q5F4S9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Trpm3Q5F4S9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trpm3Q5F4S9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trpm3Q5F4S9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trpm3Q5F4S9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trpm3Q5F4S9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trpm3Q5F4S9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trpm3Q5F4S9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpm3Q5F4S9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms