Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rtl5Q5DTT4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms