Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

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Length 884 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms