Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E7

Zc3h12a, Endoribonuclease ZC3H12A, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12aQ5D1E7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h12aQ5D1E7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc3h12aQ5D1E7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms