Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Eme2Q56A04 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eme2Q56A04 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eme2Q56A04 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eme2Q56A04 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eme2Q56A04 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eme2Q56A04 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eme2Q56A04 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eme2Q56A04 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eme2Q56A04 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eme2Q56A04 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eme2Q56A04 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eme2Q56A04 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eme2Q56A04 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eme2Q56A04 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eme2Q56A04 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eme2Q56A04 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eme2Q56A04 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eme2Q56A04 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eme2Q56A04 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eme2Q56A04 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Eme2Q56A04 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eme2Q56A04 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eme2Q56A04 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Eme2Q56A04 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eme2Q56A04 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eme2Q56A04 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eme2Q56A04 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eme2Q56A04 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eme2Q56A04 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eme2Q56A04 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eme2Q56A04 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms