Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrig2Q52KR2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 420.6 ms