Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccnl1Q52KE7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms