Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc3lQ4KL14 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc3lQ4KL14 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms