Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL13

Gm527, Uncharacterized protein C14orf28 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm527Q4KL13 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm527Q4KL13 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm527Q4KL13 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms