Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt35Q497I4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms