Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Lin28bQ45KJ6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28bQ45KJ6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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