Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim26Q3V460 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms