Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Carmil2Q3V3V9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Carmil2Q3V3V9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms