Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1D5

Pnpla1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla1Q3V1D5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla1Q3V1D5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pnpla1Q3V1D5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pnpla1Q3V1D5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pnpla1Q3V1D5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms