Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ulk4Q3V129 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk4Q3V129 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms