Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc110Q3V125 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms