Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms