Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Lrrc43Q3V0L5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrrc43Q3V0L5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrrc43Q3V0L5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrrc43Q3V0L5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrrc43Q3V0L5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Lrrc43Q3V0L5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Lrrc43Q3V0L5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Lrrc43Q3V0L5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrrc43Q3V0L5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrrc43Q3V0L5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrrc43Q3V0L5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrrc43Q3V0L5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrc43Q3V0L5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrc43Q3V0L5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrc43Q3V0L5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrc43Q3V0L5 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrc43Q3V0L5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrc43Q3V0L5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrc43Q3V0L5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrc43Q3V0L5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Lrrc43Q3V0L5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrc43Q3V0L5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrc43Q3V0L5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms