Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0I2

Prr7, Proline-rich protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr7Q3V0I2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prr7Q3V0I2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prr7Q3V0I2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms