Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Usp48Q3V0C5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp48Q3V0C5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp48Q3V0C5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Usp48Q3V0C5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Usp48Q3V0C5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Usp48Q3V0C5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Usp48Q3V0C5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Usp48Q3V0C5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp48Q3V0C5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Usp48Q3V0C5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp48Q3V0C5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp48Q3V0C5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp48Q3V0C5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Usp48Q3V0C5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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Usp48Q3V0C5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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