Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca4bQ3UW98 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms