Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW22

Defb48, Beta-defensin 42, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb48Q3UW22 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Defb48Q3UW22 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms