Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28047Q3US59 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms