Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Znf48Q3US17 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Znf48Q3US17 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Znf48Q3US17 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Znf48Q3US17 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Znf48Q3US17 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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