Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms