Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms