Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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D13Ertd608eQ3UPR8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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D13Ertd608eQ3UPR8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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D13Ertd608eQ3UPR8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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D13Ertd608eQ3UPR8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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D13Ertd608eQ3UPR8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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D13Ertd608eQ3UPR8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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D13Ertd608eQ3UPR8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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D13Ertd608eQ3UPR8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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D13Ertd608eQ3UPR8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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