Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms