Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nlrc4Q3UP24 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms